Synchronisationsschnittstelle (IEEE 1588)—Das PCI-1588 verwendet das Präzisions-Zeitprotokoll IEEE 1588-2008, um Takte und Ereignisse mit anderen IEEE-1588-basierten Geräten oder Computern zu synchronisieren. Es kann als Master- oder Slave-Taktmodul nach IEEE 1588 betrieben werden. Ein geräteeigener FPGA passt die Frequenz und Phase eines geräteeigenen IEEE-1588-Takts automatisch an. Die PCI-1588-Schnittstelle synchronisiert ihren Takt mit anderen IEEE-1588-fähigen Geräten über einen integrierten Ethernet-Port. Mit dieser synchronisierten Zeitbasis kann das PCI-1588 über universelle PFI-Leitungen Ereignisse mit Nicht-1588-Geräten wie traditionellen Instrumenten oder SPSs über SMB-Anschlüsse an der PCI-Halterung synchronisieren. Die RTSI-Schnittstelle (Real-Time System Integration) dient zur Synchronisation des PCI-1588 mit anderen PCI-Geräten im selben PC.