サンプリングクロックは、デジタル波形発生器/アナライザの主要なタイムベースです。このクロックを使用して、サンプルの集録レートまたは生成レートを制御します。サンプリングクロックの各周期ごとに、各チャンネルで1つのサンプルを集録または生成できます。

NI-HSDIOを使用して、オンボードクロックソース信号、もしくは外部周波数発生器からの信号を使用できます。デジタル波形発生器/アナライザはパイプラインアーキテクチャを採用しているため、サンプリングクロックのクロックソースは連続および自走である必要があります。また、生成および集録操作中は、周波数が一定である必要があります。