Ein Subsystem ist der Schaltkreis (Wandler, Takte, Trigger, Timing-Signale, Timing-Engine usw.), mit dem ein Gerät Samples erfasst oder erzeugt. Bei DAQ-Geräten gibt es separate Subsysteme für die analoge Erfassung und Ausgabe, Zähler und digitale I/O. Ein Subsystem ist aber nicht gleichzusetzen mit dem I/O-Typ. So ist jeder Ein- und Ausgabeschaltkreis eines Zählers ein individuelles Subsystem. Auch der Trigger-Bus kann ein Subsystem darstellen.